Раковые исследования в области биотехнологии, часть I

Прогресс в исследовании рака требует открытия новых биохимических и молекулярных мишеней для целенаправленного лечения, новых биомаркеров для выявления и диагностики раннего рака и улучшения классификации и подтипа рака для прогнозирования и выбора лечения.

Для облегчения этих целей усилия сосредоточены на понимании молекулярной основы и клеточной биологии рака человека.

Обзор нескольких выраженных генов и / или белков дает полезную информацию как для классификации, так и для прогнозирования отдельных опухолей. Разработка методологии микродиапазонив, которая позволяет выразить тысячи генов, которые нужно одновременно анализировать, представляет собой мощную технику для чтения "молекулярного подписи" отдельной пациентки. Этот процесс называется профилированием экспрессии генов (ГЭП). Анализ шаблонов экспрессии генов в отдельных пациентов с "тем самым" заболеванием может обнаружить молекулярные различия. Такая классификация позволит лучше выбирать и прогнозировать лечения.

Описание методов, используемых для GEP, будет представлен здесь. Более детальное обсуждение приложений этих методов к конкретным типам опухолей обсуждается в соответствующих темах опухоли.

GEP AND DNA MICROARRAY ANALYSIS — традиционным методом измерения уровня экспрессии единственного гена является анализ РНК методом северо-анализа. Анализ микродинамикы ДНК использует те же принципы, чтобы одновременно измерять уровень выражения тысяч генов на платформе, называется микрочином.

Существует несколько этапов для проведения анализа микрочинив:

  • Подготовка микрорайона
  • Генерирование флуоресцентных мишеней с РНК образцов
  • Гибридизация к зондов
  • Сбор данных: сканирование сигнала интенсивность, возникает с гибридизованих меченых зондов
  • анализ данных: извлечение биологически полезной информации из огромного количества данных, генерируется из анализа микрочинив. Этот аспект часто является наиболее сложным компонентом ГЭП.

Подготовка микродиаграмы — массив ДНК состоит из упорядоченного расположения пятен ДНК на стеклянном слайде или чипе. В простейшем виде несколько десятков комплементарных ДНК (кДНК) или олигонуклеотидов, соответствующие определенным генам, иммобилизованные на субстрате в известном порядке в сетке.

У высококвалифицированных "микросхемах" микрочипов синтезированы до сотен тысяч уникальных олигонуклеотидных зондов, представляющие тысячи известных генов или тегов выраженной последовательности (ESTs), в микропечати на стеклянной подложке размер миниатюры. ЭСТ являются сегментами выраженных генов, которые были секвенирован, но не соответствуют известным генам.

Каждый олигонуклеотидный зонд, специфичный для определенного гена, располагается на точном месте внутри микропечати; это клетка зонда. Каждая зондовая клетка слишком мала, примерно 24 мкм на 24 мкм, и содержит миллионы копий каждого конкретного олигонуклеотида. Специальный ген (например, ген, кодирующий тимиидилат-синтетазу) может быть представлен на микропечати 20 или более пробными клетками, называется зондом. Олигонуклеотидных зонды (как правило, от 15 до 25 нуклеотидов в длину) в каждой зондний клетке зондирующего комплекта могут отличаться друг от друга, некоторые отвечают 5-м конечном последовательности мРНК, некоторую среднюю, а некоторые 3 39; конец Это дает образцу РНК широкий спектр последовательностей, с которыми можно гибридизированных.

В общем, быстро развивается поле анализа микроаррасив ДНК и профилирования экспрессии генов имеет широкомасштабные последствия для молекулярной классификации опухолей, совершенствования прогностических оценок и прогнозирования реакции на терапию. Несмотря на свой захватывающий потенциал и значительные последние достижения, эта сфера остается относительно новой, и преждевременно сделать вывод, что данные микрочильникив могут быть использованы как единственный способ классификации раковых заболеваний или предсказания результатов лечения.

Среди конкретных проблем, которые необходимо выполнить, является необходимость проведения более масштабных исследований с должным валидацией, стандартизацией методов и установлением руководящих принципов для проведения исследований и подготовки отчетов, а также создание хранилищ и реестров, в которых научно-исследовательские учреждения могут предоставлять данные для сравнения с самостоятельными работами, включающих один и тот же злокачественный расстройство. И, наконец, тесты на основе микродиапазонив ДНК должны продемонстрировать полезность в перспективных клинических испытаниях, прежде чем эта технология рассматривается как рутинная часть клинической оценки.

Эти исследования могут в конечном итоге установить новую парадигму лечения в индивидуальной терапии рака в будущем.

Releated Post

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *